Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp397Q7TNK4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp397Q7TNK4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms