Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sbno2Q7TNB8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms