Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Shq1Q7TMX5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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