Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms