Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ScocQ78YZ6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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