Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim12Q78RX3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms