Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snd1Q78PY7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snd1Q78PY7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms