Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nme8Q715T0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms