Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sned1Q70E20 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms