Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpv1Q704Y3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpv1Q704Y3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms