Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d2bQ6ZWY6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms