Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35Q6ZWV7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms