Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpopQ6ZWS8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpopQ6ZWS8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms