Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March6Q6ZQ89 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March6Q6ZQ89 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms