Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ino80Q6ZPV2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ino80Q6ZPV2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms