Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc44a1Q6X893 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc44a1Q6X893 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms