Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scgb2b2Q6UGQ3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scgb2b2Q6UGQ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scgb2b2Q6UGQ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scgb2b2Q6UGQ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms