Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clca4aQ6Q473 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca4aQ6Q473 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms