Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sort1Q6PHU5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sort1Q6PHU5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms