Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx13Q6PHS6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx13Q6PHS6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx13Q6PHS6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms