Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scaf4Q6PFF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scaf4Q6PFF0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms