Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE87

Cfap206, Cilia- and flagella-associated protein 206, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap206Q6PE87 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfap206Q6PE87 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cfap206Q6PE87 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms