Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd4Q6PDQ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Chd4Q6PDQ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms