Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SvoplQ6PDF3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SvoplQ6PDF3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SvoplQ6PDF3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms