Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcd3Q6P9Z1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms