Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slf2Q6P9P0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms