Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc148Q6P5U8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc148Q6P5U8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc148Q6P5U8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms