Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NesQ6P5H2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NesQ6P5H2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NesQ6P5H2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NesQ6P5H2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NesQ6P5H2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms