Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg2aQ6P4T0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg2aQ6P4T0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms