Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Efcab6Q6P1E8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Efcab6Q6P1E8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Efcab6Q6P1E8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Efcab6Q6P1E8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms