Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms