Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpdc1Q6NZK8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ptpdc1Q6NZK8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpdc1Q6NZK8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpdc1Q6NZK8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms