Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt2Q6NVG7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms