Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV66

Zfp646, Zinc finger protein 646, mousemouse

Predictions only

Length 1,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp646Q6NV66 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfp646Q6NV66 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp646Q6NV66 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp646Q6NV66 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms