Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SphkapQ6NSW3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SphkapQ6NSW3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms