Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2810408A11RikQ6NSU2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms