Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amer3Q6NS69 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amer3Q6NS69 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amer3Q6NS69 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amer3Q6NS69 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amer3Q6NS69 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amer3Q6NS69 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amer3Q6NS69 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amer3Q6NS69 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amer3Q6NS69 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amer3Q6NS69 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amer3Q6NS69 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms