Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbxo41Q6NS60 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fbxo41Q6NS60 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fbxo41Q6NS60 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fbxo41Q6NS60 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms