Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm4Q6IRU2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm4Q6IRU2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms