Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt39Q6IFX4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.8 ms