Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arhgap20Q6IFT4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arhgap20Q6IFT4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms