Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Best3Q6H1V1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Best3Q6H1V1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms