Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Carmil1Q6EDY6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Carmil1Q6EDY6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms