Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms