Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmcc1Q69ZZ6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmcc1Q69ZZ6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.1 ms