Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms