Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptbn2Q68FG2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms