Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Znf280dQ68FE8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf280dQ68FE8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms