Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CltcQ68FD5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CltcQ68FD5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms