Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Papd5Q68ED3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Papd5Q68ED3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Papd5Q68ED3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms